自愈系统是生物储存、补充和调动自愈力以维持机体健康的协同性动态系统。

对于包括人类在内的高等级生物，自愈系统包含免疫系统、应激系统、修复系统（愈合和再生系统）、内分泌系统等若干个子系统，当其中任何一个子系统产生功能性、协调性障碍或者遭遇外来因素破坏，其他子系统的代偿能力都不足以完全弥补，自愈系统所产生的自愈能力就必然会降低，从而在生物体征上显现为病态或者亚健康状态。

自愈并不是万能的，每个人体质不同，自愈能力也不同，医学就是为了辅助机体自愈治疗疾病为目的而存在的。与此相应，抑制自毁的机制，即是自愈机制。