109(115)侦探团大追击事件◆
110(116)烹饪教室杀人事件(前篇)◆
111(117)烹饪教室杀人事件(后篇)◆
112(118)帝丹小学七大离奇事件
113(119)白色海滩杀人事件◆(注:该集根据漫画《名侦探柯南特别篇》第1卷改编,并非青山刚昌的原作)
114(120)有氧潜水杀人事件(前篇)
115(121)有氧潜水杀人事件(后篇)
116(122)推理小说家失踪事件(前篇)
117(123)推理小说家失踪事件(后篇)x
118(124~125)浪花连续杀人事件★x
119(126)假面超人杀人事件◆
120(127)蜜蜂鸡尾酒杀人事件◆
121(128)浴室密室事件(前篇)
122(129)浴室密室事件(后篇)
123(130)天气预报小姐绑架事件◆
124(131)神秘的狙击者杀人事件(前篇)◆
125(132)神秘的狙击者杀人事件(后篇)◆
126(133)旅行剧团杀人事件(前篇)◆
127(134)旅行剧团杀人事件(后篇)◆
128(135)黑衣组织10亿元抢劫事件◆b(注:部分情节来自漫画第2卷,但主体案件为原创)
@1999年(129~173)
129(136~139)来自黑衣组织的女子大学教授杀人事件★b
130(140)竞技场无差别胁迫事件(前篇)
131(141)竞技场无差别胁迫事件(后篇)
132(142)魔术爱好者杀人事件(事件篇)k
133(143)魔术爱好者杀人事件(疑惑篇)k
134(144)魔术爱好者杀人事件(解决篇)k
135(145)消失的凶器搜索事件◆
136(146)蓝色古堡探索事件(前篇)
137(147)蓝色古堡探索事件(后篇)
138(148)最终播映杀人事件(前篇)
139(149)最终播映杀人事件(后篇)
140(150)sos!步美传达的讯息◆
141(151)结婚前夕密室事件(前篇)x
142(152)结婚前夕密室事件(后篇)x
143(153)疑惑的天体观测◆
144(154)上野出发的北斗星3号(前篇)
145(155)上野出发的北斗星3号(后篇)
146(156)本厅刑事恋爱物语(前篇)
147(157)本厅刑事恋爱物语(后篇)
148(158)路上电车紧急刹车事件◆
149(159)游乐园高空弹跳事件◆
150(160)汽车爆炸事件的真相(前篇)◆
151(161)汽车爆炸事件的真相(后篇)◆
152(162)神秘老人失踪事件◆
153(163)园子危险的夏日物语(前篇)
154(164)园子危险的夏日物语(后篇)
155(165)水中钥匙密室事件◆
156(166)本厅刑事恋爱物语2(前篇)
157(167)本厅刑事恋爱物语2(后篇)
158(168)沉默的环状线◆
159(169)诡异的五重塔传说(前篇)◆
160(170)诡异的五重塔传说(后篇)◆
161(171)流经流水亭的杀机◆
162(172~173)飞天密室工藤新一最初的事件★s
163(174)月亮、星星与太阳的秘密(前篇)
164(175)月亮、星星与太阳的秘密(后篇)
165(176)少年侦探队消失事件◆
166(177)鸟取县蜘蛛公馆的怪事(事件篇)x
167(178)鸟取县蜘蛛公馆的怪事(疑惑篇)x
168(179)鸟取县蜘蛛公馆的怪事(解决篇)x
169(180)维纳斯之吻◆
170(181)黑暗中的死角(前篇)
171(182)黑暗中的死角(后篇)
172(183)复活的死亡讯息(前篇)
173(184)复活的死亡讯息(后篇)
@2000年(174~218)
174(185~188)二十年的杀意新佛尼号连续杀人事件★x
175(189)惨遭四次杀害的男子◆
176(190)与黑衣组织的再会(灰原篇)b
177(191)与黑衣组织的再会(柯南篇)b
178(192)与黑衣组织的再会(解决篇)b
179(193)咖啡厅卡车撞入事件◆
180(194)红色杀机的夜想曲(前篇)◆
181(195)红色杀机的夜想曲(后篇)◆
182(196)九道门大搜查◆
183(197)危险的食谱◆
184(198~199)诅咒假面的冷笑★◆
185(200)名侦探遇害记(前篇)◆
186(201)名侦探遇害记(后篇)◆
187(202)黑暗中传来的神秘枪响◆
188(203)危命的复活洞窟中的侦探团
189(204)危命的复活负伤的名侦探x
190(205)危命的复活第三种选择x
191(206)危命的复活黑衣骑士s/x
192(207)危命的复活新一回来了s/x
193(208)危命的复活约定的场所s
194(209)意味深长的八音盒(前篇)
195(210)意味深长的八音盒(后篇)
196(211)看不见的凶器小兰的初次推理◆
197(212)超级跑车的陷阱(前篇)◆
198(213)超级跑车的陷阱(后篇)◆
199(214)嫌疑犯毛利小五郎(前篇)
200(215)嫌疑犯毛利小五郎(后篇)
201(216)第十位乘客(前篇)◆
202(217)第十位乘客(后篇)◆
203(218)伊卡洛斯的黑色之翼(前篇)◆
204(219)伊卡洛斯的黑色之翼(后篇)◆
205(220)本厅刑事恋爱物语3(前篇)
206(221)本厅刑事恋爱物语3(后篇)
207(222)太顺利的推理◆
208(223~224)通往迷宫的入口巨大神像的愤怒★◆
209(225)龙神山坠崖事件◆
210(226)五彩传说的水中豪宅(前篇)◆
211(227)五彩传说的水中豪宅(后篇)◆
212(228)蘑菇、熊与侦探队(前篇)
213(229)蘑菇、熊与侦探队(后篇)
214(230)怀古饭店的神秘事件◆
215(231)复仇海滩(前篇)◆
216(232)复仇海滩(后篇)◆
217(233)目暮警官尘封的秘密(前篇)
218(234)目暮警官尘封的秘密(后篇)