如果说鬼墨是被华夏王朝所遗弃的人，那龙巫宫就是被神抛弃的精灵。龙巫宫本来叫做灵巫宫，信奉太阳十子之首的东皇太一，神王帝俊与神后羲和的儿子（其实是养子，亲生父母是帝江和凡间女子孤月氏），东皇太一的信徒们在灵山聚集，以灵歌妙舞供奉她们的东皇神君并且建立了灵巫宫。有一个出身贫苦的女孩因为容貌清丽，舞姿曼妙且拥有与生俱来的神通被选中作为供奉东皇神君的巫女，她可拥有强大的灵力，不老的容颜和永恒的生命，她会被世人尊崇，被人膜拜，拥有锦衣玉食和尊贵的地位。她是灵巫宫最强大的巫女，她叫翼遥，她爱东皇神君，本来作为信奉东皇太一的信徒巫女把自己终生的爱慕献给神明无可厚非，然而，翼遥对东皇神君的，却是另外一种爱，是凡人之间的爱恋。这种情感被祭司长和巫女们认为是亵渎了神君，于是把翼遥幽禁了一年。

但翼遥没有理会众人对她的目光，始终坚持自己心中的爱恋，一年后，被释放的她搬到山顶上继续为东皇神君歌颂。虽然众人无法理解翼遥的行为，也不愿意提起这个人，因为，亵渎神明的人会给她们灵巫宫蒙羞，但不可置否，翼遥的灵力日益强大，远超过灵巫宫的其他巫女，因为，她的歌声并非茫然服从，而是真情实感。翼遥爱神明，也渴望得到神明的爱，某一天，翼遥的歌唱引来了一位客人，不过这位客人不是翼遥梦寐以求的东皇太一，而是一条名叫瞳渊的幼蛟，希望与强大的她缔结血契，得到翼遥的一魄，成为强大的蛟龙，虽然缔结契约并不会损坏翼遥的灵力和修为，但龙却要永远听命于主人，翼遥不想从此困住瞳渊，便拒绝了瞳渊的请求。终于，她的歌声传到了神界，惊动了东皇太一，东皇太一惊于竟有如此美妙的歌声可以撼动神界，于是和二弟炎煜一同下凡探个究竟。翼遥终于见到了日思夜想的东皇太一，并表达出自己内心对他的爱恋，但是东皇太一是神，是个永远不会爱上凡人的神，他认为眼前这个凡人在亵渎他的身份，他的二弟炎煜也险些要杀了翼遥，幸有瞳渊及时现身，请求翼遥与他缔结契约才保护了翼遥，瞳渊得到了强大的力量化成蛟龙，但瞳渊和翼遥却相互遗忘了，当东皇太一拂袖使山顶漫起一片火海，包围着翼遥，翼遥没有挣扎，只是缓缓闭上眼睛，火焰消失后，那里开出一大片血红色的曼珠沙华，一个穿着华服的巫蛊娃娃站在了花丛中。

之后，太阳十子被后羿射落，灵巫宫失去了东皇神君的庇佑，巫女的容貌也开始衰老，她们不再长生不老，青春常驻，巫女从此不再固定人员，而是一代又一代地传承下去。她们迁至九嶷之巅，把灵巫宫改名龙巫宫，信奉蛟龙瞳渊。瞳渊作为她们的守护龙，作为与主人订下契约的龙依旧庇护她们，但是巫女们认为，龙对她们的庇护是不长久的，也不会无条件去守护她们，因此，每一代的巫女都会选出灵力强大者，把自己的魂魄供奉给龙，然后陷入沉睡，醒后，她与龙的记忆都会不复存在。许多走投无路的苦命女孩都会投奔到龙巫宫，因此，龙巫宫也渐渐兴旺起来。