1627年林丹汗派兵收服右翼鄂尔多斯、喀喇沁、土默特等部，与喀尔喀部却图汗结为联盟，声威大振，所辖地域东起辽东，西至甘肃。

但是好景不长，皇太极即位后，把林丹汗做为主要的敌人。大明崇祯元年1628年，派遣贝勒阿济格与老哈河上游受林丹汗统治的喀喇沁部会盟，共击林丹汗，皇太极第一次以“盟主”的身份发号施令。

9月，皇太极亲率大兵至绰洛郭尔，宴会察哈尔部控制下的敖汉、奈曼、札鲁特和喀喇沁等部领兵前来的诸首领。联合组成大军十万，在土默特的召城一战中，消耗了林丹汗精锐兵力四万余人，这使得林丹汗的实力大为削弱。

皇太极通过对察哈尔部的第一次进兵，确立了对漠南蒙古东面诸部的盟主地位，建立了蒙古归附各部对后金的臣属关系。林丹汗受到皇太极的威逼开始西迁。

崇祯六年4月，皇太极再率大军西进，多尔衮从征。初九，大军到西拉木伦河时，沿途蒙古各贝勒率所部兵来会，共同大举进攻察哈尔部，面对势力远胜自己的敌军，林丹汗无奈自归化城驱人畜十万渡黄河西逃。

后金没能与林丹汉交战，在经宣府、张家口等地，大肆侵入大明领地抢掠，饱欲而返。七月二十四日，皇太极率军回到沈阳。

蒙古各部面对已经大势已去的大汗，部众十之七八在途中散去。这些散去的部众历史上都会归附后金，李鸿基当然不能看着不管，若此次能集结重兵对抗满人，恐怕大数人会选先择投靠闯军，毕竟闯军一直和蒙古人做生意，双方已建立了良好的关系。

此次归获闯军的两个部落一个叫漠西额鲁特，首领名叫巴图尔洪台吉，此时李鸿基并不知道这个叫巴图尔洪台吉的人第四个儿子就早后来建立准葛尔王国的葛尔丹。

另一个部落是喀尔喀部，首领叫却图，他本与林丹汗结成同盟共同对付后金，林丹汗远遁，却图汗面对后金的数万铁骑，害怕报复，只得也归获闯军。

李鸿基得到两个部落的投城，大喜过望，对蒙古其它各部更有信心，刚到榆林，马上就吩咐接见两人。

巴图尔洪台吉和却图两人投靠闯军后，虽然闯军对他的部下发饷发地，但两人以前对部下生杀以夺的权力却再也没有了，不免有点牢骚，但他们的部下编入了闯军后，待遇比以前好了许多，每个人都高高兴兴，即使他们想反悔也拉不走这些人，只得认命。