之后的几年里，宇智波一族不断扩充军力，直到最后鼬的父亲通知他参与政变，但在家族和村子之间，鼬选择了村子。关于鼬为何做出这样的选择，可以去看我的“火影人物志第29期“，是我引以为豪的一篇作品。

团藏听说后当即就要先发制人，诛灭宇智波一族，猿飞日斩没有赞同，也没有阻止。但仅凭团藏的根组织可打不过宇智波，于是他找来鼬，提出了一项交易：如果你能站在木叶这边，协助诛灭宇智波一族，那么你的弟弟佐助将会得到庇护。鼬别无选择，接受了这个条件。

有观众觉得鼬这里是受到团藏威胁，被逼灭族，那就把鼬想得太狭隘了。家族和村子开战，鼬一定会选村子；佐助他也完全有能力保护，只是团藏正好提出了这个交易而已。

随后当团藏和日斩带着大批暗部杀到宇智波驻地时，鼬已经做得干干净净了。日斩下令回收所有遗体，团藏则趁乱偷了几具。这时鼬悄然出现在他面前，对他说：“我全看到了，今后我也会继续看着。要是你敢动佐助，我就把村子的机密泄露给敌国。”他在警告团藏，你偷死人的眼睛我可以不管，但千万别打佐助的主意。

宇智波事件结束后，日斩撤去了团藏火影辅佐一职，并令他解散根组织，罚他禁闭。这个惩罚对于团藏来说太轻了，宇智波叛变的起因虽然是九尾之乱引发的信任危机，但从头到尾都有团藏从中作梗的影子，为何日斩对他如此宽容？