中忍考试第二场，大蛇丸很快就找到了佐助一行人，仅凭眼神迸发的杀气就让他们无法动弹。以他的实力，要杀此时的三位主角易如反掌，但他并没有这么做，甚至在发现鸣人是人柱力后，看到九尾的查克拉泄露，他还在上面加了道五行封印。虽然对鸣人来说扰乱了他的查克拉，但对木叶村来说，加固封印显然是一个有利的做法，如果大蛇丸真心想毁灭木叶，应该解放九尾，或是带走鸣人才对呀。
中了封印术的鸣人失去了意识，小樱也不是战斗型忍者，场上只剩下了佐助。佐助还有家族大仇未报，不甘心束手待毙，危机之下写轮眼进化出了双勾玉。大蛇丸饶有兴致的测试了一番佐助的实力，这一段体术较量非常精彩，2003年的作画竟有如此水准，这种人物略微变形，动作粗放得有些抽象，同时注重技巧与忍术、忍具配合的火影式打斗风格，在这里第一次呈现。但佐助的体术还是太稚嫩，很快被大蛇丸打趴，最后佐助利用起爆符制造机会，拉出钢丝，用操手里剑之术加火遁·龙火之术将大蛇丸钉在树上，做了一道木炭烤蛇。
但这套华丽的操作并没有实质作用，大蛇丸面不改色的挣脱了钢丝，用束缚术轻易定住佐助，并在他后颈咬了一口，种下了咒印。这是理论生还率只有十分之一，实际生还率二分之二的天之咒印，寄宿了大蛇丸的灵魂力量，甚至可以从这个咒印中复活。面对全部倒地的三位主角，大蛇丸没有再出手，而是离开了。
在大蛇丸休息时，另一位天之咒印拥有者，他在木叶时的徒弟红豆找上门来。大蛇丸跟她打了个招呼：“好久不见啊，红豆。”但红豆却说：“你已经是被通缉的s级叛忍，哪怕赌上性命，我也要在这里打败你。”大蛇丸淡淡的说：“你办不到。”
红豆用潜影蛇手抓住大蛇丸，并结了双蛇相杀之印欲与他同归于尽，这时大蛇丸的声音从背后响起：“红豆，你想自杀吗？那是替身。”红豆这才发现自己差点与一滩烂泥同归于尽。在咒印的压制下，红豆只能跪地，大蛇丸走到她身前，亲切的抚摸着她的脸颊，看来师徒久别，热情如斯。
一番交流后，大蛇丸离开了，红豆立刻会见三代火影商议对策，此时他们还不清楚大蛇丸筹划了战争，因此只是加强了戒备，并没有中断这场各国大名都来观看的盛会。
后在卡卡西封印佐助的咒印时，大蛇丸再次出现，可能是担心自己未来的身体有什么闪失。看到咒印只是被封邪法印抑制，大蛇丸放下心来，面对卡卡西“同归于尽”的威胁，大蛇丸只是说：“如果你能做到，那就试试。”便头也不回的离开了。其实早在大蛇丸叛逃木叶的时候，还在暗部的卡卡西就曾奉命拦截他，他们之间有过一战，那时大蛇丸无论实力还是气势，都彻底碾压了卡卡西。这么多年过去了，面对大蛇丸，卡卡西还是颇为忌惮。
之后，中忍考试第三场终于开始了，这也是大蛇丸计划中发动进攻的时机。在这场考试中，大蛇丸伪装成风影，堂而皇之的坐在三代火影身边。大蛇丸对三代说：“您的年纪也不小了。该早点决定下一任火影的人选了。”三代大笑着说到：“我觉得自己还能再干五年呢！”他没有发现此时“风影”的眼神杀意已决。
比赛起初看起来一切正常，但暗中大批音忍和砂忍已在木叶村外围集结，兜也伪装成暗部，和其他音忍潜伏在会场，接下来到了我爱罗和佐助的比赛。
我爱罗正是大蛇丸行动的重要一环，原计划是在比赛中释放一尾砂之守鹤，并以此为信号，里应外合，一举征服木叶。可是没想到，比赛中我爱罗竟然被佐助的千鸟所伤，导致无法解放尾兽之力，不得已，大蛇丸只能跳过这一步，直接开始行动。随着兜施展大范围幻术，让会场里的普通人全部陷入沉睡，大蛇丸与三代火影四目相对，杀意夺眶而出。
一枚烟雾弹在看台上引爆，烟雾中，大蛇丸挟持了三代，跳上房顶，同时潜藏在四周的音忍四人众立刻跟上，联手施展四紫炎阵，将木叶的援兵隔绝在阵外，大蛇丸与三代形成了1v1的局面。这时兜和会场内潜伏的其他音忍全部露面，牵制住了卡卡西等人，而村外的砂忍通灵出三头巨蛇，击破了木叶的城墙，攻入村内，木叶村顿时全面陷入战局。
此时三代终于识破了大蛇丸的身份，当年一时仁慈放走的爱徒，现在终于回来要取自己的性命，三代问他：“为什么要进攻木叶？你不是个会因怨恨而行动的人。”大蛇丸说：“我看到会动的东西就觉得有趣，看到不会动的就觉得无趣。我想用摧毁木叶这阵风来转动静止的风车。”两人间的决战正式开始。
一番试探后，三代脱下了斗篷，已是全副武装，看来三代预料到了今天可能会有战斗，而大蛇丸直接使出了刚完成的秽土转生之术。随着对方召唤出写有“初”和“二”的两具棺材，三代暗道一定要阻止第三具，第三具写着“四”的棺材果然没有召唤成功，不过这应该不是三代的作用，而是因为四代的灵魂已被封印，无法进行秽土转生。
虽然四代没有召出，但光是初代和二代就不是他能对付得了的，所幸大蛇丸的这次秽土转生精度不高，与他们生前的实力相去甚远。不过三代已经年迈，实力也是大不如前，以一敌三，无论忍术还是体术都全面落于下风。当三代被树界降临困住时，他用尽全力通灵出了猿魔王，虽然争取到了喘息之机，但仍然毫无胜算。
性命的忍术！就让我们的灵魂一起，在死神肚子里永远斗争下去吧。”