他被第三代火影评为“个才华洋溢的少年，一个数十年才出一个的天才”，因此得师父器重，也让自来也对其生了嫉妒之意，认为“猿飞老师心中只有大蛇丸一个”。

在忍界大战中，大蛇丸和自来也、纲手曾联手跟雨隐村头目“山椒鱼半藏”对战。其他木叶忍者皆死伤枕籍，唯只有他们三人能支持到最后，半藏因而赐了他们“木叶三忍”的称号。

而在当年的雨隐村任务中，他们三人亦偶遇上三名雨隐村的遗孤，小南、弥彦和长门。原本大蛇丸欲斩草除根，但他们因着自来也的维护的存活下来，更得到自来也传授忍术。日后，这三个小孩的其中两人，更成为了晓的核心成员，并把自来也杀死。

大蛇丸当过特别上忍御手洗安子（御手洗红豆）的老师，也曾经一度被认为是第三代火影的继任者。但后来由于潜心研究禁术，并掳走村中忍者作为实验对象。令第三代火影及暗部注意上他的古怪行径，最终他叛离木叶，成为叛忍。

他叛离木叶的时候，自来也曾经追上去挽留他，但还是无法改变他背离木叶的决定。自来也往后仍因为当时无法把走向歧路的好朋友劝回来而自责不休，他也因此连火影也不当，多年来都暗中追踪著大蛇丸的行踪。

在晓及音忍时期，他叛离后加入晓，代号是“空”，指环戴在左手尾指上。相信在那时候，他的转生禁术即使还没完全成功，也接近成功了。在宇智波鼬加入后，由于想得到写轮眼的力量，他试图夺取宇智波鼬的身体作转生容器，但不敌对方的写轮眼幻术，遭遇惨败而失去左手，结果退出组织。

后来他结集势力，建立了自己的忍者村－音忍村，标记是八分音符，其势力范围位于火之国的北方。他的部下有药师兜，音忍五人众（即竹取君麻吕、多由也、次郎坊、鬼童丸、左近）等。忍界大战结束后，被允许在不伤害他人性命的前提下继续实验，如今制造了人造人巳杯、巳月，并留在音忍村中生活。

“看到会动的东西就很有趣……停止的东西就很无趣……”，是个拥有一个人就可以攻陷一个小国的可怕的力量的人，是为了自己的野心不惜一切代价的异类。

(三代:“在那个战乱的时代，是个才华洋溢的少年，一个数十年才出一个的异才，希望能是继承我意志和力量的少年……

疾风如果真的想要彻底解决自己的体质问题的话，那么就需要找到大蛇丸，这个亦正亦邪的人物，不过疾风自己可没有任何的保证，大蛇丸不会轻而易举的事情，

不然的话真的太不符合大蛇丸的口味了，搞不好疾风真的很有可能会把自己的小命给搭进去。疾风真很无语了，那么自己看来要想解决问题，关键还得是我们的自来也大人，想到这疾风渐渐的进入梦乡。